blog

Apr 22, 2024

Ultra da startup de PCR digital Enumerax

NOVA IORQUE – A Enumerix, uma nova empresa de PCR digital de uma equipa de estrelas da indústria genómica, saiu do modo furtivo com um método de PCR digital de baixo custo que pode gerar 30 milhões de gotículas por

NOVA IORQUE – A Enumerix, uma nova empresa de PCR digital de uma equipa de estrelas da indústria genómica, saiu do modo furtivo com um método de PCR digital de baixo custo que pode gerar 30 milhões de gotículas por reação, expandindo enormemente a gama dinâmica em relação à corrente tecnologias.

Chamado Ultra-dPCR, a empresa espera lançar um produto comercial baseado no método até o final do próximo ano, inicialmente focado nos mercados de pesquisa e testes pré-natais não invasivos.

A empresa está promovendo sua tecnologia como sequenciamento de próxima geração e, como prova de conceito da ampla faixa dinâmica, desenvolveu um ensaio NIPT que detecta um total de 222 loci nos cromossomos 13, 18 e 21 em um fluxo de trabalho de tubo único.

A Enumerix foi fundada em 2019 por Stephen Fodor, Christina Fan e Ari Chaney, um trio que anteriormente trabalhou junto na empresa de análise unicelular Cellular Research.

A equipe tem uma boa fé impressionante no espaço da genômica. Fodor foi cofundador da Affymetrix em 1992, enquanto Fan é conhecido como co-inventor do NIPT junto com Stephen Quake. Chaney, Fodor e Quake foram cofundadores da Cellular Research em 2011. Essa empresa foi adquirida em 2015 por Becton Dickinson como parte de uma estratégia genômica mais ampla para pesquisa de células únicas, enquanto a Affymetrix foi adquirida em 2016 por US$ 1,3 bilhão pela Thermo Fisher Scientific.

Aaron Solomon, gerente geral da Enumerix, disse em uma entrevista que a equipe “teve grande sucesso na Cellular Research e decidiu que era muito divertido que queriam fazer de novo”.

O método de PCR digital Enumerix não requer microfluídica, mas utiliza consumíveis baratos combinados com equipamento de laboratório padrão.

O gerador de gotas é um dispositivo de plástico com poros, disse Solomon.

Esta peça cabe em uma tira de tubo padrão de 200 microlitros. Uma amostra é carregada junto com a substância de emulsão proprietária da Enumerix e, em seguida, a tira do tubo é carregada em um adaptador que permite que ela seja colocada em qualquer centrífuga de laboratório padrão.

“Ele é girado por 20 minutos e a força centrífuga cria uma chuva de gotículas que vão para os tubos de PCR”, disse ele.

A química da emulsão da empresa foi projetada para depositar as gotículas no fundo do tubo, permitindo aquecimento e resfriamento mais eficientes em um termociclador padrão. Também é claro, por isso é simples realizar imagens 3D do tubo usando o instrumento de scanner Light Sheet proprietário da empresa.

O aumento do número de partições pode aumentar a faixa dinâmica de detecção em comparação com outros métodos. Solomon disse que as reações têm volume morto zero e podem ser carregadas com quatro vezes mais amostras do que outras tecnologias, o que pode aumentar a sensibilidade. Isto pode ser particularmente importante na detecção de moléculas raras, como em aplicações de biópsia líquida.

Conforme descrito em Química Analítica esta semana, o instrumento de imagem coleta amostras de 500 quadros das gotículas de emulsão e os compila para gerar uma reconstrução 3D do tubo de PCR. O software personalizado define então as partições e conta as gotículas fluorescentes.

O Light Sheet está atualmente configurado para detectar quatro cores, e Solomon disse que a empresa pode facilmente usar métodos combinatórios para detectar 12 alvos em um único ensaio. “Podemos fazer alguns outros truques para ir além disso”, disse ele.

O tempo total de execução é de duas horas para processar 48 amostras, e o fluxo de trabalho também pode ser automatizado.

Solomon disse que o custo total dos consumíveis por amostra é inferior a US$ 10. A Enumerix planeja comercializar os consumíveis, o instrumento leitor e o software proprietário para gerar imagens dos tubos, com o custo do scanner Light Sheet sendo “comparável com outros scanners que estão no mercado no espaço de PCR digital”, disse Solomon.

Enquanto outros instrumentos operam em quatro logs de faixa dinâmica, Solomon disse que o Ultra-dPCR estende esse intervalo em até dois logs. “Isso significa que podemos fornecer sensibilidade adicional e não precisamos titular a concentração de detecção adequada”, disse ele.